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經濟部有鑑於98年度「增加研發補助比例」措施之推動，確有加速提升國內業界積極投入研發創新之正面效益，且為持續鼓勵民間投入研發，並強化創新能量，99年度核定之計畫將參考98年度推動作法繼續推動，提供「增加研發補助比例10-15」且加成後之補助經費占核定總經費之比例均不得超過50之新措施。
經濟部為鼓勵企業投入創新研發，提升國際競爭核心優勢，已提供許多創新研發輔導及經費補助等政策措施，包括小型企業創新研發計畫（SBIR）、業界開發產業技術計畫（ITDP）、創新科技應用與服務計畫（ITAS）、協助傳統產業技術開發計畫（CITD）、主導性新產品開發輔導計畫及協助服務業研究發展輔導計畫等六大計畫，惟97年下半年以來，台灣遭逢金融海嘯衝擊，經濟部為使企業莫因金融海嘯影響而減少或暫停投入創新研發活動，故推動經濟部「產業再造-支援產業研發創新升級」政策，針對98年度核定補助款額外加成，適用期間為98年1月1日至98年12月31日止，提高該期間完成簽約之計畫原核定補助經費，大型計畫加成20 (業界開發產業技術計畫-技術處、創新科技應用與服務計畫-技術處、主導性新產品開發輔導計畫-工業局) ；小型計畫加成30 (小型企業創新研發計畫-技術處、協助服務業研究發展計畫-商業司、協助傳統產業技術開發計畫-工業局)，以鼓勵企業持續投入創新研發活動。
前開六大計畫研發補助措施之推動，對於鼓勵企業投入創新研發已見成效，在申請及核定件數方面，截至12月25日止，本（98）年度累計申請件數已達 2,779件，較97年2,213件成長26﹪；累計核定件數為1,382件，較97年898件成長54﹪。在經費補助方面，98年核定政府補助款共計 54.56億元，相較97年31.75億元共增加22.81億元，成長72﹪；廠商自籌款為80.58億元，相較97年59.82億元共增加20.76億元，成長35﹪。在執行成效方面，執行補助計畫企業共投入研發人數16,079人，較97年度增加5,209人，成長率為48﹪；新增就業機會4,080 人，較97年度增加2,147人，大幅成長2倍，並同時帶動企業研發投資逾24億元，相關資訊請參閱附檔表列。
經濟部將參考98年度「增加研發補助比例」的推動作法，於99年度持續加碼補助經費，以激發企業擴大創新研發，期能加速產業升級，並有效提升我國企業之國際競爭力，經濟部協助企業投入研發活動的努力將不會停止，未來也會積極研擬適當的政策項目，持續誘導廠商投入研發經費，以利我國產業在未來景氣復甦時能占有一席之地。
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